Le site des Bancs des Flandres intègre deux zones dans le cadre de la démarche Natura 2000 :
• une ZPS (Zone de Protection FR3112006 au titre de la directive « Oiseaux » ;
• une pSIC FR3102002 (proposition de Site d’Intérêt Communautaire) au titre de la directive « Habitat » (qui, si elle est validée évoluera en ZSC).
La ZPS (1171,67km2), s’appuie sur le trait de côte jusque l’Avant-Port Ouest de Dunkerque.
La pSIC (1129,19km2) quant à elle est entièrement marine depuis la limite des plus basses mers.
